2. CRISPR-Cas rendszerek: Ezek kifinomult immunrendszerek, amelyek számos baktériumban és archaeában megtalálhatók. Úgy működnek, mint a korábbi fág-találkozások adaptív memóriabankjai. A CRISPR-Cas rendszerek rövid RNS-molekulákat hozhatnak létre, amelyek megfelelnek a talált fágok genetikai szekvenciájának. Ezek az RNS-ek irányítják a Cas-fehérjéket, hogy pontosan megcélozzák és elpusztítsák az adott szekvenciát hordozó fág DNS-t.
3. Abortív fertőző (Abi) rendszerek: Egyes baktériumok az Abi rendszereket használják gyors reagálású védekezési mechanizmusként. Amikor egy fág beadja a DNS-ét, az Abi gyors önpusztító programot indít el a baktériumsejtben, megszakítva a fertőzést, mielőtt a fág replikációja megindulhatna. Ez a stratégia megakadályozza az utódfágok kialakulását, hatékonyan lerövidítve a fertőzési ciklust.