Nem minden betegséget okoznak mikroorganizmusok. Egyes betegségeket, például genetikai rendellenességeket, autoimmun betegségeket és sérüléseket nem mikroorganizmusok okoznak. Bár a mikroorganizmusok számos olyan betegség okozói, amelyek hatással vannak az emberi egészségre. A baktériumok, vírusok, gombák és paraziták mind betegségeket okozhatnak az emberben.
