A fehérjeemésztés végtermékei az aminosavak. A fehérjék aminosavláncokból álló nagy molekulák. Az emésztés során ezeket a fehérjéket olyan enzimek, mint a pepszin, tripszin és kimotripszin, egyre kisebb peptidekre bontják. Ezeket a peptideket ezután enzimek, például karboxipeptidázok és aminopeptidázok tovább bontják egyedi aminosavakra. Ezek az aminosavak azután felszívódnak a véráramba, és felhasználhatók új fehérjék vagy más molekulák szintetizálására, vagy tovább bonthatók energia előállítására.
