A gerincvelő azonban rendelkezik bizonyos fokú autonómiával, amelyet gerincreflexeknek neveznek. Ezek akaratlan, gyors válaszok olyan ingerekre, amelyek a gerincvelő szintjén jelentkeznek anélkül, hogy tudatos gondolkodást vagy agyi feldolgozást igényelnének. A gerincreflexek példái közé tartozik a térdrándulási reflex és az elvonási reflex, amikor a személy lába automatikusan elrángat egy fájdalmas ingertől. Ezek a reflexek nélkülözhetetlenek a szervezet sérülésekkel szembeni védelméhez és az alapvető motoros funkciók megőrzéséhez.
Ezenkívül a gerincvelő felelős a szenzoros információk továbbításáért a testből az agyba, és a motoros parancsok továbbításáért az agyból az izmokba. Ez lehetővé teszi a mozgás és az érzékszervi feldolgozás összehangolását, bár a komplex szenzoros információk feldolgozásához és a döntéshozatalhoz az agy bevonása szükséges.
Összességében, míg a gerincvelő képes bizonyos reflexeket végrehajtani és jeleket továbbítani, az agyra támaszkodik a magasabb szintű funkciók és a test mozgásainak és érzéseinek általános szabályozásában.