Például, ha a hipotalamusz azt érzékeli, hogy a testhőmérséklet túl magas, akkor jeleket küld az agytörzsnek, amitől a test izzadni kezd és hő szabadul fel. Ha a hipotalamusz azt érzékeli, hogy a test túl hideg, akkor jeleket küld az agytörzsnek, hogy a test megborzongjon és hőt takarítson meg.
A hipotalamusz szabályozza a hormonok felszabadulását is az agyalapi mirigyből. Az agyalapi mirigyet gyakran az endokrin rendszer "mestermirigyének" nevezik, mivel ez szabályozza a hormonok felszabadulását más endokrin mirigyekből. A hipotalamusz szabályozza a hormonok felszabadulását az agyalapi mirigyből azáltal, hogy jeleket küld az agyalapi mirigynek.
Például, ha a hipotalamusz azt érzékeli, hogy a szervezetnek több növekedési hormonra van szüksége, akkor jeleket küld az agyalapi mirigynek, hogy felszabadítsa a növekedési hormont. Ha a hipotalamusz azt érzékeli, hogy a szervezetnek több pajzsmirigyhormonra van szüksége, akkor jeleket küld az agyalapi mirigynek, hogy pajzsmirigyhormont szabadítson fel.
A hipotalamusz az agy nagyon fontos része, amely számos különböző testi funkciót irányít. Az autonóm idegrendszer és az endokrin rendszer a két legfontosabb rendszer, amelyet a hipotalamusz irányít.