Az atipikus follikuláris sejtek jelenléte nem feltétlenül jelenti azt, hogy a beteg daganatos megbetegedésben szenved, hiszen jóindulatú állapotokkal is összefüggésbe hozható, például pajzsmirigygyulladással vagy noduláris hiperpláziával. Fontos azonban a további vizsgálat a sejtek pontos természetének meghatározásához és az esetleges rosszindulatú daganatok kizárásához.
Az atipikus follikuláris sejtek kimutatása jellemzően további diagnosztikai vizsgálatokhoz, például további biopsziákhoz vagy képalkotó vizsgálatokhoz vezet a kóros sejtek kiterjedésének és természetének felmérésére. A kezelés menete a konkrét diagnózistól függ, és magában foglalhat gyógyszeres kezelést, műtétet vagy monitorozást.