A kolonoszkópia során a test helyzete általában a bal oldalon fekszik, térdét behajlítva és a mellkas felé húzva. Ez a pozíció segít kinyitni a vastagbelet, és megkönnyíti a kolonoszkóp behelyezését és mozgatását. A pácienst megkérhetik arra is, hogy forduljon a hátára vagy feküdjön a jobb oldalára az eljárás során.