A melaninnak két fő típusa van:az eumelanin és a pheomelanin. Az eumelanin a barna és fekete színért, míg a pheomelanin a vörös és sárga színekért. A termelődő melanin mennyiségét és típusát az OCA2 gén határozza meg.
A barna szemű emberek íriszében sok eumelanin található, míg a kék szeműeknél nagyon kevés az eumelanin. A zöld szeműeknél mérsékelt mennyiségű eumelanin, a mogyoróbarna szeműeknél pedig eumelanin és pheomelanin keveréke van.
A heterokrómia olyan állapot, amelyben egy személynek két különböző színű szeme van. Ezt okozhatja genetikai mutáció, vagy trauma vagy betegség eredménye.
Az albinizmus olyan állapot, amelyben egy személyben nagyon kevés vagy egyáltalán nincs melanin. Az albínók általában fehér hajúak, bőrük és szemeik. A szemük néha vörösnek tűnhet, mert láthatóak az írisz erei.