Autodock Atom típusai

Autodock egy oktatási platform, amely ismert atomok és egy rács interfész kombinálva kötési alkalmazások megjósolni a kötési sebesség a legtöbb kis molekulák. Ez lehetővé teszi a diákok gyakorlatilag tanulni molekula kötési anélkül, hogy költséges laboratóriumi időt és a képzés . Elemei

Autodock támogatja az alapvető elemei : H , C, N , O, F, Mg- , P- , S- , Cl , Ca, Mn, Fe , Zn, Br és I. Ezek a már parametrizálhatók a programot, hogy elismeri a fizikai jellemzők, tulajdonságok és reakciók más elemeket . Ezek az alapvető elemeket lehet használni, hogy olyan molekulát alkotnak és tesztelt kötési alkalmazás vagy oldószerben. Például egy diák azt jelzi, a két hidrogén molekula egy oxigén molekula , H2O és képes lenne kipróbálni ezt a vízmolekula ellen kötelező mértéke .
Kötelező

Autodock támogatja a különböző kötelező vagy dokkoló vegyi anyagok és elemek , a nevét és vagy a címkét a dokkoló elemet kell beírni a felhasználói felület , hogy keresse meg és válassza ki a megfelelő elemet . Autodock olyan rendszert eszközök célja, hogy segítsen nézetet , nyomon követése és felgyorsítja a kötés folyamatát . Ezek közé tartozik a röntgen- krisztallográfia ; szerkezet- alapú gyógyszer tervezés, ólom optimalizálás, virtuális szűrés ( HTS ) , kombinatorikus könyvtár kialakítás , fehérje-fehérje dokkoló és kémiai mechanizmus tanulmányokat. Ez lehetővé teszi a diák , hogy működjön együtt az elemek és a kötvény őket alá a különböző körülmények között , hogy a legjobb és legpontosabb vizsgálati eredmények érhetők el .
Rács térkép

Autodock a hálózat, vagy hálózati térkép használják párosítani , és a mérkőzés elemek kötőanyagot , erre, a tanuló kell lépnie a kémiai elem neve egybetűs formában , hogy keresse meg a rajtrácson . Elemei a rács már tanulmányozták és tesztelték , valamint a kerületük már definiált . Ez lehetővé teszi a diák , hogy egyszerűen válassza ki az atom -és kötőanyag nélkül meg részleteket . A Autodock Rács térkép tehát lehetővé teszi a hallgató , hogy megismerjék a tulajdonságait és kerülete az atom tesztelése közben a kötési ár.
Hozzáadása Elements

Ha egy diák van egy elem hogy még nem lépett Autodock rendszere , akkor adja meg a Autodock a meglévő kerület fájl pontos részletes tájékoztatást az atom szó. Ezt követően kell feltölteni Autodock és kalibrált , újra kalibrált pontosság előtt tesztelt. Ugyanakkor meg kell jegyezni , hogy ha egy elem szükséges mélyreható ismerete, hogy az elem cselekedni és reagálni során a kötési folyamat, valamint más atomokkal .