A craniotomia súlyossága számos tényezőtől függően változhat, például a bemetszés helyétől és méretétől, a kezelt alapbetegségtől és az egyén általános egészségi állapotától. Egyes craniotomiák viszonylag egyszerűek és minimális kockázattal járhatnak, míg mások összetettebbek lehetnek, és hosszú felépülési időt igényelnek.
Általánosságban elmondható, hogy a craniotomia nagy műtétnek számít, és csak akkor szabad elvégezni, ha feltétlenül szükséges. Ha azonban szükség van rájuk, életmentőek lehetnek, és jelentősen javíthatják az ember életminőségét.