A sebészek korlátozott ismeretekkel rendelkeztek az érzéstelenítésről és a steril technikáról, és gyakran fájdalomcsillapítás nélkül végeztek amputációkat és más nagyobb műtéteket. A polgárháborús kórházak halálozási aránya rendkívül magas volt, és sok katona halt bele fertőzésekbe, betegségekbe vagy műtétek szövődményeibe.
A polgárháborús kórházakban kezelt gyakoribb egészségügyi állapotok közé tartozik:
* Lőtt sebek
* amputációk
* törések
* égések
* hasmenés
* vérhas
* tüdőgyulladás
* tífusz
* himlő
* kanyaró
A polgárháború alatt az Unió hadserege létrehozta a tábori kórházak rendszerét, amelyek a frontvonalak közelében helyezkedtek el. Ezek a kórházak osztályozást és sürgősségi ellátást nyújtottak a sebesültek számára, és hozzájárultak a halálozási arány csökkentéséhez. Az uniós kórházak ellátása és személyzete is jobb volt, mint a konföderációs kórházaknak, és magasabb volt a túlélési arányuk.
A polgárháború után a konfliktus tanulságai az orvosi ellátás fejlesztéséhez vezettek mind a katonai, mind a polgári kórházakban.