A pestisorvosok fizetést kaptak szolgáltatásaikért. Általában az önkormányzat vagy egy jómódú mecénás alkalmazta őket. A fizetett összeg a pestisjárvány helyétől és súlyosságától függően változott. Egyes esetekben a pestisorvosok fix fizetést kaptak, míg más esetekben minden egyes látott beteg után díjat fizettek. A pestisorvosok fizetésükön vagy díjukon kívül gyakran egyéb juttatásokat is kaptak, például ingyenes lakhatást, élelmet és ruházatot.
