A pajzsmirigy eltávolítását, azaz a pajzsmirigy teljes eltávolítását általában előrehaladott pajzsmirigyrák, visszatérő golyva (a pajzsmirigy megnagyobbodása, amely részleges eltávolítás után is fennáll), vagy ha mindkét pajzsmirigylebeny különböző állapotokban érintettek.
A sebészek a pajzsmirigy egy részének megőrzése mellett döntenek, amikor csak lehetséges, mivel ez segít fenntartani a normál pajzsmirigyhormon-termelést, így csökkentve annak lehetőségét, hogy élethosszig tartó hormonpótló kezelésre van szükség.