Igen, bizonyos típusú pajzsmirigybetegségek, mint például a Hashimoto-féle pajzsmirigygyulladás és a Graves-kór, autoimmun betegségek. Autoimmun betegségek akkor fordulnak elő, amikor a szervezet immunrendszere tévedésből megtámadja saját szöveteit. Ezekben a bizonyos pajzsmirigybetegségekben az immunrendszer megtámadja a pajzsmirigyet, ami gyulladáshoz és a normál pajzsmirigyműködés megzavarásához vezethet. Ennek eredményeként a pajzsmirigy túl sok vagy túl kevés pajzsmirigyhormont termelhet, ami különféle pajzsmirigytünetekhez vezethet.