A betegséget okozó mikroorganizmust kórokozónak nevezzük. A kórokozók lehetnek baktériumok, vírusok, gombák vagy paraziták. Betegséget okozhatnak azáltal, hogy károsítják a sejteket, méreganyagokat termelnek, vagy immunválaszt váltanak ki. Néhány gyakori kórokozó:
- Baktériumok:Salmonella, E. coli, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae
- Vírusok:influenza vírus, HIV, hepatitis vírus, kanyaró vírus
- Gombák:Candida albicans, Aspergillus fumigatus
- Paraziták:malária parazita, horogféreg, galandféreg