A HPV antigéneknek két típusa van:
* Korai antigének: Ezek az antigének a vírus életciklusának korai szakaszában expresszálódnak, még mielőtt a vírus új vírusrészecskéket termelne.
* Késői antigének: Ezek az antigének a vírus életciklusának késői szakaszában expresszálódnak, miután a vírus új vírusrészecskéket termelt.
A HPV antigének fontos célpontjai a vakcinafejlesztésnek. Jelenleg olyan HPV elleni vakcinák állnak rendelkezésre, amelyek megakadályozhatják a méhnyakrákot okozó HPV leggyakoribb típusaival való fertőzést.