Az alkohol károsíthatja az immunrendszer működését, így az egyének fogékonyabbak a fertőzésekre. Az AIDS-ben szenvedők immunrendszere legyengült, és az alkoholfogyasztás tovább ronthatja immunrendszerüket. Ez növelheti az opportunista fertőzések, mint például a tüdőgyulladás, a tuberkulózis és a cryptococcus okozta agyhártyagyulladás kialakulásának kockázatát, amelyek az AIDS gyakori szövődményei.
Ezenkívül az alkohol károsíthatja a légzőrendszer és a gyomor-bél traktus nyálkahártyáját, így könnyebben bejuthatnak a kórokozók. Az alkohol szintén megzavarhatja a szervezet azon képességét, hogy megszabaduljon a fertőzésektől, megnehezítve az immunrendszer számára a fertőzések elleni küzdelmet.
Ezért az AIDS-ben szenvedő egyéneknek kerülniük kell vagy minimálisra kell csökkenteniük az alkoholfogyasztást, hogy csökkentsék a fertőzések és egyéb szövődmények kialakulásának kockázatát.