1. Urogenitális minták :Urogenitális fertőzések gyanúja esetén a mintákat a következő helyekről gyűjtik:
- Hímek: Húgycső (vizeletminta)
- Nők: Endocervix (tampon segítségével)
- Hímek és nőstények egyaránt: Vizeletminta, ha nem áll rendelkezésre vizelet alapú nukleinsavamplifikációs teszt (NAAT).
2. Rektális minták :Gyanús végbélfertőzés esetén egy tampont helyeznek a végbélbe, hogy mintát vegyenek.
3. Conjunctiva-minták :Kötőhártya-gyulladás (szemfertőzés) gyanúja esetén pálcikával mintát vesznek a kötőhártyából (a szem fehér részét borító átlátszó membrán).
4. Torokminták :Ritkán a chlamydia fertőzést okozhat a torokban. Egyes esetekben toroktampon is kérhető.
Alapvető fontosságú, hogy az egészségügyi szolgáltató a megfelelő mintavételi technikákat kövesse, és a begyűjtött mintákat megfelelő szállítóközegbe helyezze a pontos laboratóriumi vizsgálatok biztosítása érdekében. A pozitív chlamydia tenyésztési eredmények életképes Chlamydia trachomatis baktériumok jelenlétét jelzik. A tenyésztési teszteket azonban manapság ritkábban alkalmazzák, és a molekuláris diagnosztikai technikákat, például a NAAT-t gyakran előnyben részesítik nagyobb érzékenységük és specifitásuk miatt.