A matematikában a diszjunkt halmazokat gyakran használják az egymástól teljesen különálló objektumok gyűjteményeinek leírására. Például a gráfelméletben diszjunkt halmazokat használnak a gráf különböző összefüggő összetevőinek leírására.
A diszjunkt halmazok az adatstruktúra különböző részeinek leírására is használhatók. Például egy linkelt listában a lista különböző csomópontjai diszjunkt halmazok.
A "diszjunkt" kifejezés más típusú objektumok leírására is használható, amelyek nem halmazok. Például két egyenes vagy görbe diszjunkt, ha egyik pontban sem metszik egymást.